DeepMind оприлюднила AlphaFold 3 з кодом та вагами
Google DeepMind опублікувала AlphaFold 3 із повним кодом інференсу та модельними вагами; це важливо, бо модель доступна для локального запуску і дозволяє працювати з конфіденційними даними без передачі на сервери Google.
Google DeepMind, якою керує генеральний директор Деміс Хассабіс, і під керівництвом Джона Джампера представила AlphaFold 3 у відкритий доступ з вагами та вихідним кодом для некомерційного використання.
Рішення опублікувати повний код інференсу та модельні ваги було ухвалене після критики наукової спільноти в травні 2024 року, коли доступ до моделі був обмежений через веб‑сервер.
Технічно AlphaFold 3 використовує нову архітектуру на основі дифузійної моделі, на відміну від AlphaFold 2, яка була заснована на Evoformer. Нова архітектура дозволяє прогнозувати не лише структуру білків, а й їх взаємодії з нуклеїновими кислотами (ДНК, РНК), лігандами, іонами та модифікованими залишками.
За наданими даними, модель демонструє на 50% вищу точність у прогнозуванні взаємодій білок‑ліганд порівняно з класичними методами докінгу. Можливість запускати AlphaFold 3 локально дає дослідникам змогу інтегрувати її у великі пайплайни віртуального скринінгу ліків без необхідності завантажувати конфіденційні дані на сервери Google.