Дослідники Стенфордського університету застосували модель ШІ для пошуку полімерів, здатних ушкоджувати оболонку бактерій. Ідея — відтворити дію антимікробних пептидів за допомогою молекул, які простіше виготовляти. Про роботу повідомили 21 вересня.
Пошук серед 1,7 мільйона кандидатів
Антимікробні пептиди можуть порушувати цілісність бактеріальної мембрани, але швидко руйнуються та дорого коштують у виробництві. Полімери хімічно відрізняються від пептидів, проте деякі з них потенційно можуть діяти подібним фізичним способом.
Команда сформувала бібліотеку з 1,7 мільйона полімерних кандидатів і навчила модель передбачати їхні властивості. Оскільки даних саме про антимікробні полімери бракувало, дослідники використали інформацію про пептиди, а потім перевірили синтезовані полімери в лабораторії. На заключному етапі вони відібрали десять молекул: усі показали активність проти кишкової палички, а одна особливо добре діяла на біоплівки.
До антибіотика ще кілька етапів
Лабораторна активність не доводить ефективності чи безпеки ліків для людей. Також не варто вважати, що бактерії в принципі не зможуть виробити стійкість до нового механізму. Потрібні випробування токсичності, дії в організмі й ризику резистентності.
Про інший спосіб досліджувати й змінювати властивості біомолекул ми розповідали в матеріалі про платформу Prosecco для перевірки сотень варіантів білкового каналу.
